Rozuzlenie tajomstiev DNA pomocou vysokovýkonného počítania
Primary tabs
DNA molekula, ktorá nesie inštrukcie pre život, je ako super-skrútený povraz alebo špirálový rebrík vytvárajúci tvar známy ako dvojitá špirála. Nie je to len obyčajná molekula – je to polymér. To znamená, že tvorí dlhé reťazce zložené z opakujúcich sa stavebných jednotiek. Vďaka svojmu jedinečnému tvaru sa DNA môže krútiť, ohýbať a tvoriť zložité štruktúry, vrátane uzlov a reťazí, čo sú špeciálne druhy topológií, o ktorých sa vedci ešte stále učia mnoho nového.Vo svete vedy a na Ústave Polymérov SAV používame vysokovýkonné počítače (Devana) na simuláciu a modelovanie toho, ako sa DNA správa. Tieto počítačové simulácie, ktoré využívajú techniky ako molekulová dynamika a metódy Monte Carlo, nám umožňujú skúmať,ako sa DNA krúti, rozpletá a organizuje vo vnútri buniek, čím vytvára 3D štruktúry, ktoré vidíme v chromozómoch. Tieto simulácie sú kľúčové pre zodpovedanie dôležitých otázok v rôznych oblastiach, ako je biológia, chémia a dokonca nanotechnológia. Na tejto prednáške si vysvetlíme, ako tieto simulácie fungujú, ako sa DNA môže rozpletať a ako sa jej zložité tvary porovnávajú s tým, čo pozorujeme v experimentoch.Taktiež sa pozrieme na to, ako môžeme skúmať tieto uzly a zapletenia v špeciálnych drobných kanálikoch v nanotechnologických zariadeniach, ktoré nám pomáhajú lepšie pochopiť túto jedinečnú molekulu.